RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395802.7

VAPB-202, Transcript of VAMP associated protein B and C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VAPB, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPB-202ENST00000395802 PTK2Q05397 1052 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 AKR1B10O60218 316 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 BAIAP3O94812 1187 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 KRT5P13647 590 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 TUSC3Q13454 348 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 SPA17Q15506 151 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 FAM84AQ96KN4 292 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 GPR88Q9GZN0 384 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 124.7
VAPB-202ENST00000395802 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.66□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 FAM163BP0C2L3 166 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 PDE6CP51160 858 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 12
VAPB-202ENST00000395802 DPH6Q7L8W6 267 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 ZNF677Q86XU0 584 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 MMS19Q96T76 1030 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 CHP1Q99653 195 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 BCO2Q9BYV7 579 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VAPB-202ENST00000395802 CARNS1A5YM72 827 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 KPNA7A9QM74 516 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 NDUFA10O95299 355 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 AMHP03971 560 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CCDC175P0C221 793 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 ASPAP45381 313 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 HGSNATQ68CP4 663 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TMEM270Q6UE05 265 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CISHQ9NSE2 258 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TRIP11Q15643 1979 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 PODXLO00592 558 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 POMCP01189 267 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CSF2RAP15509 400 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 GUCY2FP51841 1108 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 LILRA4P59901 499 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 KAT5Q92993 513 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 IL23AQ9NPF7 189 aa14.64□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 HUS1O60921 280 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 KIF11P52732 1056 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 MTF1Q14872 753 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 NAB2Q15742 525 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 SLC18A3Q16572 532 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 UPP1Q16831 310 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 APPL2Q8NEU8 664 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 ARID3AQ99856 593 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 MIOSQ9NXC5 875 aa14.63□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CYP26A1O43174 497 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CYP11B1P15538 503 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TNFAIP3P21580 790 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CLCNKBP51801 687 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 FPGSQ05932 587 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAPB-202ENST00000395802 TTC3P53804 2025 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms