RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PALD1Q9ULE6 856 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RTL1A6NKG5 1358 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCO2A6NFE2 343 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.21□□□□□ -1.25
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RABGEF1-202ENST00000380828 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 SULT1E1P49888 294 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GPX6P59796 221 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4F8P98187 520 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 NAA35Q5VZE5 725 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q8NFD4 153 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SULT1B1O43704 296 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SCTRP47872 440 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 STK33Q9BYT3 514 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNG2Q9Y698 323 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WZG4 1122 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.2□□□□□ -1.26
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