RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373006.5

USP49-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP49, Length 3,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49-201ENST00000373006 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CRY2Q49AN0 593 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TEKT4Q8WW24 435 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MAGEB2O15479 319 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PDK4Q16654 411 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PASD1Q8IV76 773 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KIFAP3Q92845 792 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MIPEPQ99797 713 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.5□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 GOLGA8RI6L899 631 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RFC5P40937 340 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ECE1P42892 770 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CRKP46108 304 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CCDC6Q16204 474 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RNF220Q5VTB9 566 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KRT39Q6A163 491 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 139.2
USP49-201ENST00000373006 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 NT5C1BQ96P26 610 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TRIM4Q9C037 500 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KCND2Q9NZV8 630 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CFAP69A5D8W1 941 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 POLR2MP0CAP2 368 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KRT4P19013 534 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ADSSP30520 456 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RASSF2P50749 326 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 SCNN1BP51168 640 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MYBPC2Q14324 1141 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 VPS72Q15906 364 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 HAUS1Q96CS2 278 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 COA1Q9GZY4 146 aa14.49□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 A0A0G2JND7 137 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CFHP08603 1231 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MARK3P27448 753 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KLC1Q07866 573 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CCNG2Q16589 344 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MAPK6Q16659 721 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RAB20Q9NX57 234 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PIK3CDO00329 1044 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PTPN4P29074 926 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 TRAF1Q13077 416 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RFX8Q6ZV50 586 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 GMCL1Q96IK5 515 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 USP20Q9Y2K6 914 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 POTEJP0CG39 1038 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ADRA1DP25100 572 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 KLRC2P26717 231 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 PIK3CAP42336 1068 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CENPCQ03188 943 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 GPS1Q13098 491 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 C2CD2Q9Y426 696 aa14.48□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.47□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 E7ENQ6 273 aa14.47□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 ARSEP51690 589 aa14.47□□□□□ -0.09
USP49-201ENST00000373006 RCN1Q15293 331 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms