RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 GUCY2CP25092 1073 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ADCY1Q08828 1119 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF280DQ6N043 979 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ELMOD1Q8N336 334 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 DCLK2Q8N568 766 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 SUSD3Q96L08 255 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 PNMA5Q96PV4 448 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 KIF2CQ99661 725 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TIPINQ9BVW5 301 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 GDE1Q9NZC3 331 aa11.29□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF197O14709 1029 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 CXCL8P10145 99 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 MYL4P12829 197 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 GJA1P17302 382 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 FECHP22830 423 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 FCARP24071 287 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 CCR2P41597 374 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 MAGEA9P43362 315 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 SMTNP53814 917 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TWF1Q12792 350 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TPGS2Q68CL5 300 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 IQCEQ6IPM2 695 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 APPL2Q8NEU8 664 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 RUBCNQ92622 972 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 RMDN1Q96DB5 314 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 BICD1Q96G01 975 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 BRD9Q9H8M2 597 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 COL4A2P08572 1712 aa11.28□□□□□ -0.6
CLRN3-201ENST00000368671 NCAM2O15394 837 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CLDN3O15551 220 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 OR4Q2P0C623 313 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PLA2G4BP0C869 781 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TNFSF9P41273 254 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 SLC12A3P55017 1021 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MCL1Q07820 350 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 HYIQ5T013 277 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TSSK4Q6SA08 328 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZPBP2Q6X784 338 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 DNASE1L2Q92874 299 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 NELL2Q99435 816 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 CEP72Q9P209 647 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 NCDNQ9UBB6 729 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 KIF3AQ9Y496 699 aa11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 H3BQV1 296 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 GDI1P31150 447 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 LIG4P49917 911 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 GUCY2FP51841 1108 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 NCKAP1LP55160 1127 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 TEAD2Q15562 447 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 VITQ6UXI7 678 aa11.26□□□□□ -0.61
CLRN3-201ENST00000368671 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms