RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 USP38Q8NB14 1042 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SYCE1LA8MT33 242 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CST8O60676 142 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CEP19Q96LK0 163 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TEX12Q9BXU0 123 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 EPN3Q9H201 632 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TBX20Q9UMR3 447 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RAD51CO43502 376 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2B6P20813 491 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2H1P32780 548 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 AGR3Q8TD06 166 aa21.26■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.996e-7■■■□□ 15.6
CCSAP-203ENST00000366687 SLC37A4O43826 429 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GRAP2O75791 330 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KRT4P19013 534 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MUTP22033 750 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CENPCQ03188 943 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 STX3Q13277 289 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 LZICQ8WZA0 190 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MTSS1O43312 755 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 LONRF1Q17RB8 773 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HPDLQ96IR7 371 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CASS4Q9NQ75 786 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GPD1P21695 349 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KLK7P49862 253 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRN2Q92932 1015 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 E9PCH4 1651 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CETPP11597 493 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CHN1P15882 459 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 DGKDQ16760 1214 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 BOLA3Q53S33 107 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf22Q6V702 233 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CUL3Q13618 768 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NOTUMQ6P988 496 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PGM1P36871 562 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA4P41247 253 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 GRB10Q13322 594 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HIC1Q14526 733 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CCL15Q16663 113 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KAZALD1Q96I82 304 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA4P43358 317 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KYNUQ16719 465 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ISCUQ9H1K1 167 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 NAGPAQ9UK23 515 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH1A1P00352 501 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 KLRK1P26718 216 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CAP2P40123 477 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP2BQ9UQN3 213 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TLR2O60603 784 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H2ADP20671 130 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 TSC22D3Q99576 134 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms