RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 VCAM1P19320 739 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 FGFR2P21802 821 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TRIM15Q9C019 465 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.056e-9■■□□□ 12.9
NCKAP1-201ENST00000360982 ZFATQ9P243 1243 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 MST1RQ04912 1400 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 DCTN3O75935 186 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 LRG1P02750 347 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 PMS2P54278 862 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 UGP2Q16851 508 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP5HO75947 161 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 RAD23BP54727 409 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SEPT8Q92599 483 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 FOPNLQ96NB1 174 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 H7C4K7 107 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ASMTLO95671 621 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SREBF1P36956 1147 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 CDR2Q01850 454 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 NAGPAQ9UK23 515 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TBX20Q9UMR3 447 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 A0A1B0GTH6 734 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 PLSCR1O15162 318 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 MTSS1O43312 755 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 HMBSP08397 361 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ARSEP51690 589 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 IL31Q6EBC2 164 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SZRD1Q7Z422 152 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 GPC2Q8N158 579 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC2A3P11169 496 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 OPTNQ96CV9 577 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ECT2Q9H8V3 914 aa21.58■■□□□ 1.05
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP9BO43861 1147 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 TGFB3P10600 412 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 NAMPTP43490 491 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 GALCP54803 685 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 MORF4L2Q15014 288 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 DNERQ8NFT8 737 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 B3GAT3O94766 335 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 TBCCQ15814 346 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 ANP32DO95626 131 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 HIF1AQ16665 826 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 SENP2Q9HC62 589 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 LSP1P33241 339 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 CUL3Q13618 768 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGEF7Q14155 803 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 MUC3BQ9H195 1237 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 MEGF6O75095 1541 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 HOXC6P09630 235 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST1H2ADP20671 130 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 CHSY1Q86X52 802 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 CFAP99D6REC4 459 aa21.57■■□□□ 1.04
NCKAP1-201ENST00000360982 PHEXP78562 749 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms