RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.49□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 DEFB118Q96PH6 123 aa6.49□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.49□□□□□ -1.37
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CCR6-201ENST00000341935 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.47□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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