RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 NSL1Q96IY1 281 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 GGA1Q9UJY5 639 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 GBP5Q96PP8 586 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 83.1
PPP1CC-201ENST00000335007 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 FGFR1P11362 822 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 VPS52Q8N1B4 723 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MKL1Q969V6 931 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ACCSQ96QU6 501 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PSTPIP1O43586 416 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TBX10O75333 385 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CETN2P41208 172 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 SNAP25P60880 206 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MAPK6Q16659 721 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM11Q96F44 468 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP69A5D8W1 941 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBED4O75132 1171 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 BMP3P12645 472 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR18Q9BV38 432 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A1W2PPM1 405 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 TISP43B9A030 160 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNQ2O43526 872 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 FDX1P10109 184 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP24Q8N264 748 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 NYAP2Q9P242 653 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 HEY2Q9UBP5 337 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF536O15090 1300 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 A8MXQ7 604 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIN3BO60391 1043 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJC6O75061 913 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNQ4P56696 695 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 DAW1Q8N136 415 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRN2Q92932 1015 aa21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PPP1CC-201ENST00000335007 GAS7O60861 476 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT4P19013 534 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 HELQQ8TDG4 1101 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 RPS6KA4O75676 772 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 PROSCO94903 275 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINB4P48594 390 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 SEMA4DQ92854 862 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 NT5C1BQ96P26 610 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 IWS1Q96ST2 819 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 EPAS1Q99814 870 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.39■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A0G2JND7 137 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP2A1O14983 1001 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ADRA1DP25100 572 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 ARFIP2P53365 341 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT72Q14CN4 511 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC142Q17RM4 750 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.38■■□□□ 1.01
PPP1CC-201ENST00000335007 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms