RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 DPH6Q7L8W6 267 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 UBR7Q8N806 425 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TC2NQ8N9U0 490 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SPATA18Q8TC71 538 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 BCO2Q9BYV7 579 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SCN5AQ14524 2016 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD62A6NC57 917 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CUL2Q13617 745 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 UPP1Q16831 310 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RASIP1Q5U651 963 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ABI1Q8IZP0 508 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SPC24Q8NBT2 197 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RNF169Q8NCN4 708 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SHC3Q92529 594 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 HPDLQ96IR7 371 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GPR88Q9GZN0 384 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 F8VZ95 297 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LRRN2O75325 713 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TACC1O75410 805 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KRT19P08727 400 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC172P0C7W6 258 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FGFR1P11362 822 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KRT9P35527 623 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PRKCIP41743 596 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 STAT1P42224 750 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ASPAP45381 313 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KCNJ6P48051 423 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TAF6P49848 677 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LILRA4P59901 499 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MEA1Q16626 185 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PTPN21Q16825 1174 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF365Q70YC5 407 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC43Q8N309 656 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 DPF3Q92784 378 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TATDN2Q93075 761 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SLC9A7Q96T83 725 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CITO14578 2027 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC53A6NM62 1247 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KPNA7A9QM74 516 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PODXLO00592 558 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 DDHD2O94830 711 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 POMCP01189 267 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ACRP10323 421 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FERP16591 822 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ANXA13P27216 316 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SOX5P35711 763 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CLCNKBP51801 687 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 APBA1Q02410 837 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 INCA1Q0VD86 236 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RRAGAQ7L523 313 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FAM84AQ96KN4 292 aa6.32□□□□□ -1.4
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