RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 SMC2O95347 1197 aa26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 FEZF2Q8TBJ5 459 aa26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 GSDMAQ96QA5 445 aa26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TNFRSF10AO00220 468 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D4O60343 1298 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ITGB3P05106 788 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 MTHFRP42898 656 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 SLC8B1Q6J4K2 584 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF280DQ6N043 979 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 SLC9A9Q8IVB4 645 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA20Q8TB22 786 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 SENP8Q96LD8 212 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 INTS13Q9NVM9 706 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 DMAC2Q9NW81 257 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 RFPL2O75678 378 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ODC1P11926 461 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TAF6P49848 677 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ARPP19P56211 112 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2HP62256 183 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 CYP24A1Q07973 514 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 PSMD6Q15008 389 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 GPR149Q86SP6 731 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 GJD3Q8N144 294 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 SMARCE1Q969G3 411 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF560Q96MR9 790 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 CD320Q9NPF0 282 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 TSC2P49815 1807 aa26.95■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 PTPRJQ12913 1337 aa26.95■■□□□ 1.91
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CALUO43852 315 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 OAZ2O95190 189 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 NR3C1P04150 777 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 PNPLA4P41247 253 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 MYBPC2Q14324 1141 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 LIN9Q5TKA1 542 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 USP37Q86T82 979 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 WDR49Q8IV35 697 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC127Q96BQ5 260 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 FNBP1Q96RU3 617 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 POMKQ9H5K3 350 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 C19orf67A6NJJ6 358 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 TNNC2P02585 160 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 KRT19P08727 400 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 DLATP10515 647 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 TYMPP19971 482 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 RBP5P82980 135 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ROR1Q01973 937 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 SV2CQ496J9 727 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CXorf38Q8TB03 319 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 BORCS6Q96GS4 357 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 KPNA7A9QM74 516 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ZMYND10O75800 440 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 TNNI1P19237 187 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 OVOS1Q6IE37 1185 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC52Q8N7C0 313 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CGRRF1Q99675 332 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 WDR27A2RRH5 827 aa26.92■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 CYB561D2O14569 222 aa26.92■■□□□ 1.9
CXCL2-201ENST00000296031 ABLIM3O94929 683 aa26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms