RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292579.11

ZNF250-201, Transcript of zinc finger protein 250, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF250, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250-201ENST00000292579 STILQ15468 1287 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ADAM2Q99965 735 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 VCX3BQ9H321 246 aa9.86□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TSPAN3O60637 253 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 GJB7Q6PEY0 223 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TMEM247A6NEH6 219 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CFLARO15519 480 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CASP4P49662 377 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CDR2Q01850 454 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SENP1Q9P0U3 644 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CDC23Q9UJX2 597 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CYP11B2P19099 503 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TM4SF1P30408 202 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 LRRC43Q8N309 656 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PPM1NQ8N819 430 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SPDL1Q96EA4 605 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PANX2Q96RD6 677 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 WDCPQ9H6R7 721 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SLC12A8A0AV02 714 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 F5H5T6 163 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 M0QYT0 321 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TTC4O95801 387 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 HSPA6P17066 643 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SMARCA1P28370 1054 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 NAMPTP43490 491 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ACADSBP45954 432 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ARID5BQ14865 1188 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 REPS2Q8NFH8 660 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 MAML1Q92585 1016 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TTC17Q96AE7 1141 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 KAZALD1Q96I82 304 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 DPP7Q9UHL4 492 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PHLPP1O60346 1717 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TTI1O43156 1089 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 RTN2O75298 545 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PCDH8O95206 1070 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CXCL8P10145 99 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TAP1Q03518 808 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 17.3
ZNF250-201ENST00000292579 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.85□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CHRNA3P32297 505 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 NPTX2P47972 431 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 PPP3CCP48454 512 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 NDUFV1P49821 464 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 LIG3P49916 1009 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 STK4Q13043 487 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 MAP2K5Q13163 448 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 CES5AQ6NT32 575 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 FOPNLQ96NB1 174 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 SLIT1O75093 1534 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 USP32Q8NFA0 1604 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 KIF3CO14782 793 aa9.84□□□□□ -0.83
ZNF250-201ENST00000292579 KRT14P02533 472 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms