RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXO32Q969P5 355 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SLITRK1Q96PX8 696 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ADNPQ9H2P0 1102 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 MOXD2PA6NHM9 499 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 KRT38O76015 456 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 RALBP11234 206 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXO4P98177 505 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SPARCL1Q14515 664 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SHCBP1Q8NEM2 672 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXO41Q8TF61 875 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CERS4Q9HA82 394 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPK13O15264 365 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CTIFO43310 598 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PDHA1P08559 390 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 USP10Q14694 798 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM132BQ14DG7 1078 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 LY6KQ17RY6 165 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 REEP2Q9BRK0 252 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 A6NNZ2 444 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 FAXCQ5TGI0 409 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 IZUMO3Q5VZ72 239 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 GJB7Q6PEY0 223 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 C19orf81C9J6K1 198 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 KRT7P08729 469 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX10P56693 466 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CTXN3Q4LDR2 81 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 NOTUMQ6P988 496 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA18Q8TC71 538 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa12.45□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 HPCAP84074 193 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PALB2Q86YC2 1186 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP70Q8NHQ1 597 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TASP1Q9H6P5 420 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB6BQ9NRW1 208 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CSF1RP07333 972 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 GTF2H1P32780 548 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 C16orf59Q7L2K0 433 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 INPP5DQ92835 1189 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SGF29Q96ES7 293 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 HPDLQ96IR7 371 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFATQ9P243 1243 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SSH2Q76I76 1423 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 SH3BGRLO75368 114 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTR2P61160 394 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 COG1Q8WTW3 980 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPRHQ9HD43 1115 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 DPP3Q9NY33 737 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PDHXO00330 501 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 STAG3L1P0CL83 205 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP2C8P10632 490 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TNNI3P19429 210 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF21AQ96BD5 680 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCB6Q9NP58 842 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 NR1D1P20393 614 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 LIFRP42702 1097 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 EFNA5P52803 228 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ITPK1Q13572 414 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKS6Q68DC2 871 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 GPRC5CQ9NQ84 441 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 STAP2Q9UGK3 403 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 CRB1P82279 1406 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PTCH1Q13635 1447 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 RHOBTB1O94844 696 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ODC1P11926 461 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 AKAP5P24588 427 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PARD6BQ9BYG5 372 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 EPC1Q9H2F5 836 aa12.44□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ORC4O43929 436 aa12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ACO1P21399 889 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 PMS2P54278 862 aa12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM32Q13049 653 aa12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 NRBF2Q96F24 287 aa12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 EXO5Q9H790 373 aa12.43□□□□□ -0.42
UBASH3B-201ENST00000284273 ABHD10Q9NUJ1 306 aa12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms