RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 OATP04181 439 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ABHD2P08910 425 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CD58P19256 250 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DLG4P78352 724 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FMO1Q01740 532 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SPP2Q13103 211 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 HIF1AQ16665 826 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CYP1B1Q16678 543 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 C5orf60A6NFR6 353 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NFIBO00712 420 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB39O15060 712 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PRPSAP2O60256 369 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 LLGL1Q15334 1064 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BORCS6Q96GS4 357 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BTBD6Q96KE9 485 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BATF3Q9NR55 127 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NFASCO94856 1347 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KRT37O76014 449 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 IL18RAPO95256 599 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PTGER2P43116 358 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BAG6P46379 1132 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PTP4A2Q12974 167 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CDKL2Q92772 493 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BCS1LQ9Y276 419 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NRAPQ86VF7 1730 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PTGIRP43119 386 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ACTR2P61160 394 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TRADDQ15628 312 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KRT35Q92764 455 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ADRB2P07550 413 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 RXRBP28702 533 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 HOXD13P35453 343 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 STILQ15468 1287 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BBS9Q3SYG4 887 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 IER5Q5VY09 327 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 C4orf22Q6V702 233 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SEC14L1Q92503 715 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 KLC2Q9H0B6 622 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZWILCHQ9H900 591 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CFAP69A5D8W1 941 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 RRM1P23921 792 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 IRX4P78413 519 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 LRRC38Q5VT99 294 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 VCX3BQ9H321 246 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NHSQ6T4R5 1651 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 A6NJR5 290 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 STAMBPO95630 424 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DYNLT1P63172 113 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MUM1Q2TAK8 710 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CFAP157Q5JU67 520 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 WDR49Q8IV35 697 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ALG3Q92685 438 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CYTH2Q99418 400 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NOD2Q9HC29 1040 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms