RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 TRIM72Q6ZMU5 477 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ARL8AQ96BM9 186 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CPB2Q96IY4 423 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TRIM31Q9BZY9 425 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 SIX4Q9UIU6 781 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 O00370 1275 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 HSF2BPO75031 334 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PHF2O75151 1096 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 GJB6O95452 261 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 DUPD1Q68J44 220 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TRIM11Q96F44 468 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 AKT3Q9Y243 479 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TRPC3Q13507 836 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TTMPQ5BVD1 217 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 MAGEB2O15479 319 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 NFICP08651 508 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 RARAP10276 462 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PHKA2P46019 1235 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 JAMLQ86YT9 394 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TFAP2BQ92481 460 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 VCPIP1Q96JH7 1222 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ERP44Q9BS26 406 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 POLIQ9UNA4 740 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 LACTBL1A8MY62 500 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 MYO1FO00160 1098 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 LMAN1P49257 510 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PPP2R5EQ16537 467 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF699Q32M78 642 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CXorf38Q8TB03 319 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TINF2Q9BSI4 451 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PCYOX1Q9UHG3 505 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ERICH4A6NGS2 130 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 STAG3L1P0CL83 205 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 FKBP1BP68106 108 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CYP1B1Q16678 543 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CFAP58Q5T655 872 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 WDTC1Q8N5D0 677 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 C1orf127Q8N9H9 656 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 MMP3P08254 477 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 HSPA6P17066 643 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 MMP8P22894 467 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CHRNA3P32297 505 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 HSD17B3P37058 310 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 KAT6AQ92794 2004 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PROSCO94903 275 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ACVR2BQ13705 512 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 COL1A2P08123 1366 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TNNC2P02585 160 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 JADE1Q6IE81 842 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 FSCN2O14926 492 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 SLC1A1P43005 524 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 RAP1GAPP47736 663 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 LIN9Q5TKA1 542 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 ZMYND15Q9H091 742 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 RAB17Q9H0T7 212 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 GOLGA6CA6NDK9 693 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 FAM187AA6NFU0 413 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 H0YGN5 161 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 OPA1O60313 960 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 IL18RAPO95256 599 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 KRT19P08727 400 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-201ENST00000252771 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms