RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 BCO2Q9BYV7 579 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 OR6C75A6NL08 312 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 GLULP15104 373 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA1Q5VX52 437 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 FAM170BA6NMN3 283 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TYMPP19971 482 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 PLD1Q13393 1074 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 POTEHQ6S545 545 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ADSSL1Q8N142 457 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 FIZ1Q96SL8 496 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ASAH2Q9NR71 780 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CEP72Q9P209 647 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 DERAQ9Y315 318 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 NCAM2O15394 837 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 LRRN2O75325 713 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CCR2P41597 374 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEA9P43362 315 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 GUCY2FP51841 1108 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 LILRA4P59901 499 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 GPR17Q13304 367 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ADALQ6DHV7 355 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 JADE1Q6IE81 842 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 DNASE1L2Q92874 299 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 EPSTI1Q96J88 318 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 GPR88Q9GZN0 384 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ASB7Q9H672 318 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CLIC4Q9Y696 253 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SP9P0CG40 484 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MYL4P12829 197 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 EPHA5P54756 1037 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MYBPC2Q14324 1141 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SMARCD2Q92925 531 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ASB16Q96NS5 453 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 STK17AQ9UEE5 414 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 OR4Q2P0C623 313 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ODC1P11926 461 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CD72P21854 359 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 FCARP24071 287 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ALDH1A3P47895 512 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ACOT2P49753 483 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 EPHB3P54753 998 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP4Q13115 394 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 PTPAQ15257 358 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SENP8Q96LD8 212 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 BRD9Q9H8M2 597 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 YIPF1Q9Y548 306 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 R4GN57 208 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 DMDP11532 3685 aa22.83■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 PIRO00625 290 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 MOSPD3O75425 235 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 PSMC3P17980 439 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 TXLNAP40222 546 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 POSTNQ15063 836 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 CENPPQ6IPU0 288 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 USP49Q70CQ1 688 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 DYMQ7RTS9 669 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-201ENST00000250495 IRF7Q92985 503 aa22.82■■□□□ 1.24
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