RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLVAPQ9BX97 442 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 THAP9Q9H5L6 903 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPG21Q9NZD8 308 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LAMA3Q16787 3333 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CARNS1A5YM72 827 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 H3BNC9 293 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 RFXAPO00287 272 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPEF2O14830 753 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ALDH2P05091 517 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRPAP1P30533 357 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DLG4P78352 724 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 BFSP1Q12934 665 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 GPM6BQ13491 265 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 GRIN2CQ14957 1233 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 UPP1Q16831 310 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM169Q96HH4 297 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DPP3Q9NY33 737 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A1W2PQC6 194 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LGALS16A8MUM7 142 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 GRM6O15303 877 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LPXNO60711 386 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CSPG5O95196 566 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ITGB3P05106 788 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM49P0CI25 452 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM49CP0CI26 452 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT13P13646 458 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TNNI1P19237 187 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAJB1P25685 340 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CASP14P31944 242 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 VAMP7P51809 220 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLDN10P78369 228 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLCB3Q01970 1234 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CXorf38Q8TB03 319 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMC2Q8TDI7 906 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF516Q92618 1163 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 BORCS6Q96GS4 357 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAI1Q9UI46 699 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLXNA3P51805 1871 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ANO9A1A5B4 782 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 B3GAT3O94766 335 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 EFEMP2O95967 443 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TNNC2P02585 160 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC175P0C221 793 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 BRCC3P46736 316 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ENPEPQ07075 957 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CAMK1Q14012 370 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTF1Q14872 753 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 FUT10Q6P4F1 479 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 DEFB123Q8N688 67 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 POF1BQ8WVV4 589 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 GUCD1Q96NT3 240 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 VPS16Q9H269 839 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 SIX4Q9UIU6 781 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 LZTS1Q9Y250 596 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms