RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEP152	O94986	1710 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	DEPDC5	O75140	1603 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	PTPRM	P28827	1452 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	KANK1	Q14678	1352 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-222	ENST00000641901	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABCC3	O15438	1527 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	C3	P01024	1663 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZMYM3	Q14202	1370 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	MROH2A	A6NES4	1674 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	TET3	O43151	1660 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMC1	Q8TDI8	760 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	TESK2	Q96S53	571 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-222	ENST00000641901	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		10.15	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	NPAT	Q14207	1427 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	RALBP1	Q15311	655 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRPM2	O94759	1503 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	LAMC1	P11047	1609 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	ERVK-7	P63135	1459 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	NUDC	Q9Y266	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	TNR	Q92752	1358 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	PTPRT	O14522	1441 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMF1	P82094	1093 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	PANK3	Q9H999	370 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	KIF1B	O60333	1816 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	NLRP13	Q86W25	1043 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SAMMSON-222	ENST00000641901	SYNM	O15061	1565 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	HSPA2	P54652	639 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	NOS1	P29475	1434 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZBTB22	O15209	634 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	IQGAP1	P46940	1657 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	IDI1	Q13907	227 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	PIK3C2B	O00750	1634 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	NLRP1	Q9C000	1473 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	STAC3	Q96MF2	364 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	ADGRB3	O60242	1522 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPL	O60437	1756 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDCA8	Q53HL2	280 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYOM2	P54296	1465 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPP2R1A	P30153	589 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SAMMSON-222	ENST00000641901	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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