RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf170-201ENST00000623052 ASXL2Q76L83 1435 aa17.72■□□□□ 0.43
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C9orf170-201ENST00000623052 LMTK2Q8IWU2 1503 aa17.71■□□□□ 0.43
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C9orf170-201ENST00000623052 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.7■□□□□ 0.42
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C9orf170-201ENST00000623052 CDCA8Q53HL2 280 aa17.67■□□□□ 0.42
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C9orf170-201ENST00000623052 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
C9orf170-201ENST00000623052 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.42
C9orf170-201ENST00000623052 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa17.64■□□□□ 0.42
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C9orf170-201ENST00000623052 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.64■□□□□ 0.41
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C9orf170-201ENST00000623052 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.61■□□□□ 0.41
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C9orf170-201ENST00000623052 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.6■□□□□ 0.41
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A1P11836 297 aa17.59■□□□□ 0.41
C9orf170-201ENST00000623052 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.59■□□□□ 0.41
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C9orf170-201ENST00000623052 NBR1Q14596 966 aa17.58■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.56■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 ABCC3O15438 1527 aa17.56■□□□□ 0.4
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C9orf170-201ENST00000623052 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 USP32Q8NFA0 1604 aa17.54■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 NSD3Q9BZ95 1437 aa17.53■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 GLI2P10070 1586 aa17.53■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
C9orf170-201ENST00000623052 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.51■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 CD109Q6YHK3 1445 aa17.51■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.5■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.5■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.5■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 BCAR3O75815 825 aa17.5■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.49■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.48■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.48■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 SLC24A1O60721 1099 aa17.47■□□□□ 0.39
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