RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	ABCC1	P33527	1531 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	MRE11	P49959	708 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	USP19	O94966	1318 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CPEB1-215	ENST00000617958	ESPN	B1AK53	854 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	TERF1	P54274	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	NUP155	O75694	1391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	PKD2	Q13563	968 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	KIF3B	O15066	747 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	PLIN1	O60240	522 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	PZP	P20742	1482 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	GGT6	Q6P531	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	MCM4	P33991	863 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CPEB1-215	ENST00000617958	AAMP	Q13685	434 aa		13.71	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	MLEC	Q14165	292 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	GLI2	P10070	1586 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAK2	O60296	914 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS3	P49796	1198 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	FGD1	P98174	961 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CPEB1-215	ENST00000617958	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	NEO1	Q92859	1461 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	OFD1	O75665	1012 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	PTMS	P20962	102 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CPEB1-215	ENST00000617958	A2M	P01023	1474 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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