RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 ATP7AQ04656 1500 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 ASXL2Q76L83 1435 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 CLTCL1P53675 1640 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 TRPM2O94759 1503 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 MADDQ8WXG6 1647 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 APAF1O14727 1248 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 NEUROD2Q15784 382 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 PTPRTO14522 1441 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 GOLGA2Q08379 1002 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 LAMC1P11047 1609 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 RAPGEF3O95398 923 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDP1-207ENST00000591598 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 STAC3Q96MF2 364 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 NOS1P29475 1434 aa22■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 PDE4AP27815 886 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 OSCARQ8IYS5 282 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 TET3O43151 1660 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 CEP152O94986 1710 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 MORC1Q86VD1 984 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 IQGAP1P46940 1657 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-207ENST00000591598 STK26Q9P289 416 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 CD109Q6YHK3 1445 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 BCAR3O75815 825 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 ERVK-7P63135 1459 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 SLFN5Q08AF3 891 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 RGS3P49796 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 DEPDC5O75140 1603 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 SYNMO15061 1565 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
CTDP1-207ENST00000591598 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 NPATQ14207 1427 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 ABCA6Q8N139 1617 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 BACH2Q9BYV9 841 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 CABP2Q9NPB3 220 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF521Q96K83 1311 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 PIK3C2GO75747 1445 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 SLC24A1O60721 1099 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 KIF1BO60333 1816 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 MTHFSP49914 203 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-207ENST00000591598 INSRP06213 1382 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 MROH2AA6NES4 1674 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 MYOM1P52179 1685 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 E9PSI1 815 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 MYOM2P54296 1465 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 IDI1Q13907 227 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 WWC1Q8IX03 1113 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 PANK1Q8TE04 598 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 MS4A1P11836 297 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 SLC4A3P48751 1232 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 COG6Q9Y2V7 657 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDP1-207ENST00000591598 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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