RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580361.1

RAB31-208, Transcript of RAB31, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB31, Length 367 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB31-208	ENST00000580361	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-208	ENST00000580361	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-208	ENST00000580361	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB31-208	ENST00000580361	AMHR2	Q16671	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	SULF1	Q8IWU6	871 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	CLCN1	P35523	988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	PPP4C	P60510	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	BCAM	P50895	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	TRIM66	O15016	1216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	PTPN5	P54829	565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	WBP1L	Q9NX94	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	RNF40	O75150	1001 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB31-208	ENST00000580361	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	IFFO2	Q5TF58	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	CFH	P08603	1231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	SLC10A3	P09131	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	CD46	P15529	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	GCGR	P47871	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	PDE4D	Q08499	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	APLP1	P51693	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	USP46	P62068	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	NR1I2	O75469	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	GJA5	P36382	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	KCNC4	Q03721	635 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	KDM4A	O75164	1064 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	MTR	Q99707	1265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAB31-208	ENST00000580361	ZPR1	O75312	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	MS4A1	P11836	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	FUT2	Q10981	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	MORN1	Q5T089	497 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361		Q3C1V9	767 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	HOXA2	O43364	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	COPS2	P61201	443 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	ADH1B	P00325	375 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361		A0A0G2JS52	829 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	SPTLC1	O15269	473 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	RGS20	O76081	388 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	FDX1	P10109	184 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	GGCX	P38435	758 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	ZNF516	Q92618	1163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	SPSB2	Q99619	263 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAB31-208	ENST00000580361	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms