RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TET3O43151 1660 aa16.43■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GGT6Q6P531 493 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEP152O94986 1710 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEPDC5O75140 1603 aa16.41■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IQGAP1P46940 1657 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRBNQ96SW2 442 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 INSRP06213 1382 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SYNMO15061 1565 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.33■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.33■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OSCARQ8IYS5 282 aa16.33■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.33■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOS1P29475 1434 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLGA2Q08379 1002 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD109Q6YHK3 1445 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERVK-7P63135 1459 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APAF1O14727 1248 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC24A1O60721 1099 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCA6Q8N139 1617 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SKAP1Q86WV1 359 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYOM2P54296 1465 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIK3C2GO75747 1445 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RAPGEF3O95398 923 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF1BO60333 1816 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYOM1P52179 1685 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPATQ14207 1427 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF521Q96K83 1311 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MROH2AA6NES4 1674 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDE4AP27815 886 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NBR1Q14596 966 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLFN5Q08AF3 891 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MORC1Q86VD1 984 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEUROD2Q15784 382 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADGRB3O60242 1522 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BACH2Q9BYV9 841 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.21■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BCAR3O75815 825 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MS4A1P11836 297 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFT172Q9UG01 1749 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 E9PSI1 815 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STK26Q9P289 416 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCC3O15438 1527 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IDI1Q13907 227 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CABP2Q9NPB3 220 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MTHFSP49914 203 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WWC1Q8IX03 1113 aa16.15■□□□□ 0.18
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