RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		24.4	■■□□□ 1.5
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		24.4	■■□□□ 1.5
RRN3-205	ENST00000563559	KIF3B	O15066	747 aa		24.38	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	24.38	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		24.38	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R1A	P30153	589 aa		24.38	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		24.37	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	MYOM2	P54296	1465 aa		24.37	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	24.36	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	24.35	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		24.35	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		24.35	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3C2G	O75747	1445 aa		24.35	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
RRN3-205	ENST00000563559	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		24.32	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		24.32	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	KIF1B	O60333	1816 aa		24.31	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		24.3	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	MYOM1	P52179	1685 aa		24.3	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	ASXL2	Q76L83	1435 aa		24.28	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		24.28	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A1	P11836	297 aa		24.28	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	24.27	■■□□□ 1.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		24.26	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA6	Q8N139	1617 aa		24.25	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	IFT172	Q9UG01	1749 aa		24.25	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		24.24	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		24.24	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		24.24	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		24.23	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF521	Q96K83	1311 aa		24.23	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA2	Q08379	1002 aa		24.22	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-7	P63135	1459 aa		24.22	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		24.21	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		24.21	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		24.21	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	PLIN1	O60240	522 aa		24.2	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		24.2	■■□□□ 1.47
RRN3-205	ENST00000563559	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		24.2	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	NGEF	Q8N5V2	710 aa		24.19	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	24.19	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	CRBN	Q96SW2	442 aa		24.19	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		24.18	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		24.18	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	24.17	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRB3	O60242	1522 aa		24.16	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	24.16	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	PDE4A	P27815	886 aa		24.16	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	MROH2A	A6NES4	1674 aa		24.15	■■□□□ 1.46
RRN3-205	ENST00000563559	BACH2	Q9BYV9	841 aa		24.14	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	24.13	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLFN5	Q08AF3	891 aa		24.13	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		24.13	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	24.12	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		24.11	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	NOS1	P29475	1434 aa		24.11	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		24.1	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		24.1	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	CD109	Q6YHK3	1445 aa		24.08	■■□□□ 1.45
RRN3-205	ENST00000563559	NPAT	Q14207	1427 aa		24.08	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	PPL	O60437	1756 aa		24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559		E9PSI1	815 aa		24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	24.07	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		24.06	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	APAF1	O14727	1248 aa		24.05	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		24.05	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	24.05	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		24.05	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		24.04	■■□□□ 1.44
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	24.01	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRB1	O14514	1584 aa		24.01	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	GGT6	Q6P531	493 aa		24.01	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		24	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	24	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	24	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC3	O15438	1527 aa		24	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		23.99	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		23.99	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	MORC1	Q86VD1	984 aa		23.98	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		23.97	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	USP32	Q8NFA0	1604 aa		23.97	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	NEO1	Q92859	1461 aa		23.96	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	23.96	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	NBR1	Q14596	966 aa		23.96	■■□□□ 1.43
RRN3-205	ENST00000563559	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		23.95	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		23.95	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	23.95	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		23.94	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	23.94	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	23.93	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		23.93	■■□□□ 1.42
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		23.92	■■□□□ 1.42

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