RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	PTGER2	P43116	358 aa		11.81	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		11.8	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		11.8	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.78	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.78	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	MAP3K1	Q13233	1512 aa		11.78	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.77	□□□□□ -0.52
NUMB-231	ENST00000559312	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	EMP3	P54852	163 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	PHF14	O94880	888 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	DDX12P	Q92771	950 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	GLI2	P10070	1586 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	FOSB	P53539	338 aa		11.73	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		11.73	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	ERBB3	P21860	1342 aa		11.73	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	EPAS1	Q99814	870 aa		11.72	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	KIF14	Q15058	1648 aa		11.71	□□□□□ -0.53
NUMB-231	ENST00000559312	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	OSBP	P22059	807 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-231	ENST00000559312	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	PLCH2	O75038	1416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	MAP3K7	O43318	606 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	NEO1	Q92859	1461 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.59	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	FANCA	O15360	1455 aa		11.59	□□□□□ -0.55
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.58	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	PTPRE	P23469	700 aa		11.57	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.57	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.57	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		11.57	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	NUTM2F	A1L443	756 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	POTEM	A6NI47	508 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	PBX2	P40425	430 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.54	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.54	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.53	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		11.53	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.52	□□□□□ -0.56

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