RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-211ENST00000552253 CEP152O94986 1710 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-211ENST00000552253 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRB-211ENST00000552253 KANK1Q14678 1352 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 KIF1BO60333 1816 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRB-211ENST00000552253 ASXL2Q76L83 1435 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 SLC4A2P04920 1241 aa7.79□□□□□ -1.16
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PTPRB-211ENST00000552253 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 ADGRB3O60242 1522 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-211ENST00000552253 APAF1O14727 1248 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRB-211ENST00000552253 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 C8orf34Q49A92 452 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 E9PSI1 815 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 NGEFQ8N5V2 710 aa7.74□□□□□ -1.17
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