RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539741.5

TM7SF3-208, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-208ENST00000539741 ABCC3O15438 1527 aa28.79■■■□□ 2.2
TM7SF3-208ENST00000539741 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TM7SF3-208ENST00000539741 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.75■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.74■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 ERVK-7P63135 1459 aa28.74■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.73■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 CEP152O94986 1710 aa28.73■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 E9PCH4 1651 aa28.73■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TM7SF3-208ENST00000539741 TRPM2O94759 1503 aa28.69■■■□□ 2.18
TM7SF3-208ENST00000539741 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TM7SF3-208ENST00000539741 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TM7SF3-208ENST00000539741 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.66■■■□□ 2.18
TM7SF3-208ENST00000539741 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.62■■■□□ 2.17
TM7SF3-208ENST00000539741 SLIT1O75093 1534 aa28.59■■■□□ 2.17
TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.59■■■□□ 2.17
TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.59■■■□□ 2.17
TM7SF3-208ENST00000539741 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.58■■■□□ 2.17
TM7SF3-208ENST00000539741 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-208ENST00000539741 LTKP29376 864 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-208ENST00000539741 EID1Q9Y6B2 187 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-208ENST00000539741 PIK3C2BO00750 1634 aa28.53■■■□□ 2.16
TM7SF3-208ENST00000539741 CLTCL1P53675 1640 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-208ENST00000539741 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-208ENST00000539741 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-208ENST00000539741 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-208ENST00000539741 NOS1P29475 1434 aa28.45■■■□□ 2.15
TM7SF3-208ENST00000539741 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.45■■■□□ 2.14
TM7SF3-208ENST00000539741 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TM7SF3-208ENST00000539741 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.44■■■□□ 2.14
TM7SF3-208ENST00000539741 TMEM94Q12767 1356 aa28.43■■■□□ 2.14
TM7SF3-208ENST00000539741 POTEAQ6S8J7 498 aa28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-208ENST00000539741 STAC3Q96MF2 364 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-208ENST00000539741 KIF1BO60333 1816 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 KCNA6P17658 529 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 ADGRB3O60242 1522 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 RGL3Q3MIN7 710 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 PHLPP1O60346 1717 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-208ENST00000539741 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 NWD1Q149M9 1564 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 IDI1Q13907 227 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 MYOM2P54296 1465 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 MSH6P52701 1360 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.28■■■□□ 2.12
TM7SF3-208ENST00000539741 BCANQ96GW7 911 aa28.26■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.25■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 SLAIN2Q9P270 581 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 IFT172Q9UG01 1749 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 JCADQ9P266 1359 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 LAMC1P11047 1609 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-208ENST00000539741 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.18■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.15■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 USP47Q96K76 1375 aa28.14■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.14■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.14■■■□□ 2.1
TM7SF3-208ENST00000539741 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.14■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 PPLO60437 1756 aa28.14■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.11■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.1■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 ZFYVE9O95405 1425 aa28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 LRP6O75581 1613 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.08■■■□□ 2.09
TM7SF3-208ENST00000539741 C14orf37Q86TY3 774 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.07■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 SHPRHQ149N8 1683 aa28.06■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 PIK3C2GO75747 1445 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.02■■■□□ 2.08
TM7SF3-208ENST00000539741 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
TM7SF3-208ENST00000539741 TBX22Q9Y458 520 aa28■■■□□ 2.07
TM7SF3-208ENST00000539741 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.99■■■□□ 2.07
TM7SF3-208ENST00000539741 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.99■■■□□ 2.07
TM7SF3-208ENST00000539741 DIP2AQ14689 1571 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.9 ms