RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
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PTPRB-204ENST00000538708 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 ST18O60284 1047 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM29Q14134 588 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 CEP89Q96ST8 783 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRB-204ENST00000538708 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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