RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.6□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.6□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.6□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLPP6Q8IY26 295 aa8.6□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HECW1Q76N89 1606 aa8.59□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC34A2O95436 690 aa8.59□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MFSD10Q14728 455 aa8.59□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.58□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPRGP23470 1445 aa8.58□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.58□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K1Q13233 1512 aa8.56□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.56□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAPTM4AQ15012 233 aa8.56□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.56□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TIAM1Q13009 1591 aa8.55□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSEN2P49810 448 aa8.54□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNH8Q96L42 1107 aa8.54□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.53□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR70Q9NW82 654 aa8.52□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.52□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.52□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.52□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARXQ96QS3 562 aa8.51□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UACAQ9BZF9 1416 aa8.51□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA8O94911 1581 aa8.51□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.5□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.5□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARID3CA6NKF2 412 aa8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC2Q92887 1545 aa8.48□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMK2BQ13554 666 aa8.48□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.48□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OXER1Q8TDS5 423 aa8.48□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.47□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D12O60347 775 aa8.47□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.47□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF11O15085 1522 aa8.47□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.46□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.46□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.46□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.46□□□□□ -1.05
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.46□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 E2F4Q16254 413 aa8.46□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.46□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP10BO94823 1461 aa8.45□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF14Q15058 1648 aa8.43□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.43□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K9P80192 1104 aa8.43□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.43□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNK17Q96T54 332 aa8.43□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.42□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNT2BQ93097 391 aa8.42□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.42□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.42□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCOA2Q15596 1464 aa8.41□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.41□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.4□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPYSL4O14531 572 aa8.4□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.4□□□□□ -1.06
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCE2BO14633 110 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EVI5O60447 810 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.38□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.38□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.38□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.38□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GFRA3O60609 400 aa8.37□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.37□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.37□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.37□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIA2Q96PC5 1412 aa8.37□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.36□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGAEP38570 1179 aa8.36□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASXL2Q76L83 1435 aa8.35□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDIA6Q15084 440 aa8.35□□□□□ -1.07
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF787Q6DD87 383 aa8.35□□□□□ -1.07
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