RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZMYND10O75800 440 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM161AQ3B820 660 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BARGINQ6ZT62 677 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 WBP1LQ9NX94 342 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PRR14Q9BWN1 585 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IFFO2Q5TF58 517 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RNF40O75150 1001 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SULF1Q8IWU6 871 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC102AQ96A19 550 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PHOX2BQ99453 314 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CLCN1P35523 988 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 APLP1P51693 650 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC10A3P09131 477 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KCNC4Q03721 635 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AK7Q96M32 723 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CFHP08603 1231 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AMHR2Q16671 573 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IL21Q9HBE4 155 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RDH13Q8NBN7 331 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NLRP7Q8WX94 980 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MTRQ99707 1265 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRIM66O15016 1216 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CD46P15529 392 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GCGRP47871 477 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 A0A0G2JS52 829 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NR1I2O75469 434 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RGS20O76081 388 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ATP6V1AP38606 617 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 USP46P62068 366 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZPR1O75312 459 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COPS2P61201 443 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KDM4AO75164 1064 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PDE4DQ08499 809 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FUT2Q10981 343 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MORN1Q5T089 497 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF516Q92618 1163 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GGCXP38435 758 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ADH1BP00325 375 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q3C1V9 767 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HOXA2O43364 376 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GJA5P36382 358 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 THAP11Q96EK4 314 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPSB2Q99619 263 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MS4A1P11836 297 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BRICD5Q6PL45 260 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TLL1O43897 1013 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MSS51Q4VC12 460 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FDX1P10109 184 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RNF223E7ERA6 249 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 S1PR4O95977 384 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPTLC1O15269 473 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms