RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.45■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 CD109Q6YHK3 1445 aa28.44■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.44■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.44■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.44■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 SLC24A1O60721 1099 aa28.43■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.42■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 PPP2R1AP30153 589 aa28.41■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 MYOM2P54296 1465 aa28.41■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 SYNMO15061 1565 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-213ENST00000494398 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.38■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.38■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 GGT6Q6P531 493 aa28.37■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.36■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 KIF1BO60333 1816 aa28.35■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.34■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.33■■■□□ 2.13
CERKL-213ENST00000494398 MSH5O43196 834 aa28.32■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 ABCA6Q8N139 1617 aa28.32■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.32■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.31■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.29■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 NPATQ14207 1427 aa28.29■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 NOS1P29475 1434 aa28.28■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.28■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 ERVK-7P63135 1459 aa28.27■■■□□ 2.12
CERKL-213ENST00000494398 MROH2AA6NES4 1674 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 MYOM1P52179 1685 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 PIK3C2GO75747 1445 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 ADGRB3O60242 1522 aa28.25■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.24■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 IFT172Q9UG01 1749 aa28.24■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 RAPGEF3O95398 923 aa28.23■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CERKL-213ENST00000494398 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.2■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.2■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.2■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.19■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 PLIN1O60240 522 aa28.17■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 NEO1Q92859 1461 aa28.17■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.17■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.16■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 ABCC3O15438 1527 aa28.16■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.15■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.14■■■□□ 2.1
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA2Q08379 1002 aa28.14■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.12■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 ZNF521Q96K83 1311 aa28.12■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.11■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.11■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 PPLO60437 1756 aa28.09■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CERKL-213ENST00000494398 CRBNQ96SW2 442 aa28.07■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.06■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 ADGRB1O14514 1584 aa28.06■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 APAF1O14727 1248 aa28.06■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.04■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 SLFN5Q08AF3 891 aa28.04■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.02■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.02■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 MORC1Q86VD1 984 aa28.02■■■□□ 2.08
CERKL-213ENST00000494398 IDI1Q13907 227 aa28■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.98■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.98■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.98■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 NGEFQ8N5V2 710 aa27.97■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.97■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 EVC2Q86UK5 1308 aa27.96■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.96■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 PIK3C2BO00750 1634 aa27.95■■■□□ 2.07
CERKL-213ENST00000494398 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 E9PSI1 815 aa27.93■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.93■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.93■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.93■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 RICTORQ6R327 1708 aa27.92■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 GLI2P10070 1586 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms