RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	JPH4	Q96JJ6	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	ARID3A	Q99856	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXW7	Q969H0	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	GABBR2	O75899	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	NPR3	P17342	541 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBXN4-208	ENST00000490163	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	SSFA2	P28290	1259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	FOSB	P53539	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	MAP3K9	P80192	1104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	8e-8	■■■■□ 25.6
UBXN4-208	ENST00000490163	NUTM2F	A1L443	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	PHF12	Q96QT6	1004 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	GML	Q99445	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP9B	O43861	1147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	PRSS12	P56730	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	USP46	P62068	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBXN4-208	ENST00000490163	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.84	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.84	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	POTEC	B2RU33	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	POTEM	A6NI47	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	TCF3	P15923	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	GCGR	P47871	477 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	IGHA2	P01877	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UBXN4-208	ENST00000490163	QPCT	Q16769	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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