RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485729.1

HFE-212, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 3

Gene HFE, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-212ENST00000485729 HMGXB3Q12766 1538 aa8.72□□□□□ -1.01
HFE-212ENST00000485729 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HFE-212ENST00000485729 CLCN1P35523 988 aa8.72□□□□□ -1.01
HFE-212ENST00000485729 TATDN2Q93075 761 aa8.72□□□□□ -1.01
HFE-212ENST00000485729 FAM117AQ9C073 453 aa8.72□□□□□ -1.01
HFE-212ENST00000485729 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.72□□□□□ -1.01
HFE-212ENST00000485729 NBPF26B4DH59 902 aa8.71□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.71□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 PNMA3Q9UL41 463 aa8.71□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 ARHGEF11O15085 1522 aa8.7□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 RCCD1A6NED2 376 aa8.7□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 SMAPO00193 183 aa8.7□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 MS4A1P11836 297 aa8.7□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.7□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.7□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.68□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.68□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.67□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 WDR62O43379 1518 aa8.66□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 DNAJB2P25686 324 aa8.66□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.66□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.65□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HFE-212ENST00000485729 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 TK2O00142 265 aa8.63□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.62□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.61□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.61□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.59□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 NBPF3Q9H094 633 aa8.59□□□□□ -1.03
HFE-212ENST00000485729 CD46P15529 392 aa8.58□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.58□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.58□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SULF1Q8IWU6 871 aa8.58□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SMARCA4P51532 1647 aa8.58□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 HRO43593 1189 aa8.57□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.56□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.56□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.56□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 ARAP1Q96P48 1450 aa8.56□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.55□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 GOPCQ9HD26 462 aa8.55□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.55□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SLC10A3P09131 477 aa8.54□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.54□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 RDH13Q8NBN7 331 aa8.54□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.54□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.53□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.53□□□□□ -1.04
HFE-212ENST00000485729 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.52□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 POTEGQ6S5H5 508 aa8.52□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 GCGRP47871 477 aa8.51□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 SLF2Q8IX21 1173 aa8.51□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.51□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 POTEMA6NI47 508 aa8.5□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.5□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 STAC3Q96MF2 364 aa8.5□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 SLC4A3P48751 1232 aa8.49□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.49□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.49□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 RNF40O75150 1001 aa8.48□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 KDM4AO75164 1064 aa8.48□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.48□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 LRCH3Q96II8 777 aa8.48□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.47□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.47□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.47□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.47□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
HFE-212ENST00000485729 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.46□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 NDUFV2P19404 249 aa8.46□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.46□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.46□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.45□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 SPTLC1O15269 473 aa8.45□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 CFHP08603 1231 aa8.45□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 BCAMP50895 628 aa8.45□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 WNT2BQ93097 391 aa8.45□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 USP46P62068 366 aa8.44□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 HOXA2O43364 376 aa8.43□□□□□ -1.06
HFE-212ENST00000485729 FUT2Q10981 343 aa8.43□□□□□ -1.06
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