RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.76■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.76■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 PTPRTO14522 1441 aa23.75■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 STAC3Q96MF2 364 aa23.74■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 IQGAP1P46940 1657 aa23.74■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.73■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 CDCA8Q53HL2 280 aa23.73■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.72■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.72■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 PPP2R1AP30153 589 aa23.72■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 PLIN1O60240 522 aa23.71■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 CLTCL1P53675 1640 aa23.71■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.71■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.71■■□□□ 1.39
SSR4-209ENST00000482902 CEP152O94986 1710 aa23.7■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 KANK1Q14678 1352 aa23.68■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 DEPDC5O75140 1603 aa23.68■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 GSE1Q14687 1217 aa23.67■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 SYNMO15061 1565 aa23.66■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 TET3O43151 1660 aa23.66■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.65■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 ATP7AQ04656 1500 aa23.65■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 KIF3BO15066 747 aa23.65■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 CRBNQ96SW2 442 aa23.64■■□□□ 1.38
SSR4-209ENST00000482902 FANCAO15360 1455 aa23.64■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.63■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.62■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.62■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.62■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 NFKBIBQ15653 356 aa23.61■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.59■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 PIK3C2GO75747 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.58■■□□□ 1.37
SSR4-209ENST00000482902 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.58■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.58■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 SKAP1Q86WV1 359 aa23.58■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 ADGRL1O94910 1474 aa23.57■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.57■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 MYOM1P52179 1685 aa23.56■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 ZNF521Q96K83 1311 aa23.56■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 GOLGA2Q08379 1002 aa23.55■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.55■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.55■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.55■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.55■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 MYOM2P54296 1465 aa23.53■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.53■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.52■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 SLC24A1O60721 1099 aa23.52■■□□□ 1.36
SSR4-209ENST00000482902 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.51■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 ERVK-7P63135 1459 aa23.51■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 ABCA6Q8N139 1617 aa23.5■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 SLC4A3P48751 1232 aa23.5■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 SLFN5Q08AF3 891 aa23.49■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.47■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.47■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 ASXL2Q76L83 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.46■■□□□ 1.35
SSR4-209ENST00000482902 APAF1O14727 1248 aa23.45■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 KIF1BO60333 1816 aa23.44■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.41■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 MROH2AA6NES4 1674 aa23.4■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.4■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 NOS1P29475 1434 aa23.4■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 IFT172Q9UG01 1749 aa23.4■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.39■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SSR4-209ENST00000482902 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.39■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 C8orf34Q49A92 452 aa23.38■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.37■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 E9PSI1 815 aa23.37■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.36■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 FAM161AQ3B820 660 aa23.36■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.36■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 ADGRB3O60242 1522 aa23.36■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.35■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 NGEFQ8N5V2 710 aa23.33■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 BCAR3O75815 825 aa23.33■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.33■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.33■■□□□ 1.33
SSR4-209ENST00000482902 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.32■■□□□ 1.32
SSR4-209ENST00000482902 NPATQ14207 1427 aa23.31■■□□□ 1.32
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