RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473298.6

SOGA3-205, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SOGA3, Length 3,350 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-205ENST00000473298 KANK1Q14678 1352 aa13.25□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.25□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 GLI2P10070 1586 aa13.25□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.24□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.24□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 TESK2Q96S53 571 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 ADGRL2O95490 1459 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 SLC24A1O60721 1099 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 RALBP1Q15311 655 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 POGKQ9P215 609 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 MORC1Q86VD1 984 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 CRBNQ96SW2 442 aa13.23□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.22□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 A2MP01023 1474 aa13.22□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.22□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.22□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.21□□□□□ -0.29
SOGA3-205ENST00000473298 SLC4A3P48751 1232 aa13.21□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 PPP2R1AP30153 589 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.17□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 ERBINQ96RT1 1412 aa13.17□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.17□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 PLA2R1Q13018 1463 aa13.17□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 BCAR3O75815 825 aa13.17□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.17□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.16□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.16□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.16□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.15□□□□□ -0.3
SOGA3-205ENST00000473298 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 ABCA6Q8N139 1617 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 RICTORQ6R327 1708 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 ATP10AO60312 1499 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 PLXNC1O60486 1568 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 MTHFSP49914 203 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 IDI1Q13907 227 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 KDM5CP41229 1560 aa13.11□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 CDCA8Q53HL2 280 aa13.11□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 ARXQ96QS3 562 aa13.11□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 PANK1Q8TE04 598 aa13.11□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 COG6Q9Y2V7 657 aa13.11□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 GOLGA2Q08379 1002 aa13.1□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.1□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.1□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 TNNQ9UQP3 1299 aa13.1□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.09□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 C14orf37Q86TY3 774 aa13.09□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 PRAM1Q96QH2 718 aa13.09□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.09□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 NOS1P29475 1434 aa13.09□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SOGA3-205ENST00000473298 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 HMOX1P09601 288 aa13.08□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.07□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.06□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.04□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 CABP1Q9NZU7 370 aa13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 CEP152O94986 1710 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 ZNF428Q96B54 188 aa13.02□□□□□ -0.32
SOGA3-205ENST00000473298 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SOGA3-205ENST00000473298 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.02□□□□□ -0.33
SOGA3-205ENST00000473298 PDE4AP27815 886 aa13.01□□□□□ -0.33
SOGA3-205ENST00000473298 APBB1O00213 710 aa13.01□□□□□ -0.33
SOGA3-205ENST00000473298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.4 ms