RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLF2Q8IX21 1173 aa8.72□□□□□ -1.01
RPS3AP9-201ENST00000417027 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.72□□□□□ -1.01
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR37O15354 613 aa8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 IL21Q9HBE4 155 aa8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.7□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 RCCD1A6NED2 376 aa8.69□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAJB2P25686 324 aa8.69□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 GNPATO15228 680 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 FECHP22830 423 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRR14Q9BWN1 585 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 OATP04181 439 aa8.66□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.65□□□□□ -1.02
RPS3AP9-201ENST00000417027 TLL1O43897 1013 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NLRP7Q8WX94 980 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CFHP08603 1231 aa8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC10A3P09131 477 aa8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZPR1O75312 459 aa8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q6ZNB5 142 aa8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GGCXP38435 758 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP2K5Q13163 448 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PHOX2BQ99453 314 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GFRA3O60609 400 aa8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF223E7ERA6 249 aa8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCE2BO14633 110 aa8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 S1PR4O95977 384 aa8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 IRF6O14896 467 aa8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 RDH13Q8NBN7 331 aa8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 NR1I2O75469 434 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 SULF1Q8IWU6 871 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC102AQ96A19 550 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADH1BP00325 375 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 FUT2Q10981 343 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZMYND10O75800 440 aa8.47□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.47□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 BARGINQ6ZT62 677 aa8.47□□□□□ -1.05
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC19A1P41440 591 aa8.46□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 LAPTM4AQ15012 233 aa8.46□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.46□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 MORN1Q5T089 497 aa8.44□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.44□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCGRP47871 477 aa8.43□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.43□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPSB2Q99619 263 aa8.43□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.43□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPRYD7Q5W111 196 aa8.42□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.42□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLCN1P35523 988 aa8.41□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 THAP11Q96EK4 314 aa8.41□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.41□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD46P15529 392 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP6V1AP38606 617 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNFRSF10AO00220 468 aa8.39□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.39□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 HLA-CQ95604 372 aa8.39□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMHR2Q16671 573 aa8.36□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 BRICD5Q6PL45 260 aa8.35□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 GDF9O60383 454 aa8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 KDM4AO75164 1064 aa8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXC1Q12948 553 aa8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 AK7Q96M32 723 aa8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP9-201ENST00000417027 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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