RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384121.1

RNU6-890P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 890, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-890P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-890P-201ENST00000384121 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 GGCXP38435 758 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM161AQ3B820 660 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZPR1O75312 459 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 CFHP08603 1231 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-890P-201ENST00000384121 GNPATO15228 680 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.27□□□□□ -1.25
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RNU6-890P-201ENST00000384121 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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RNU6-890P-201ENST00000384121 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 NR1I2O75469 434 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 Q6ZNB5 142 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-890P-201ENST00000384121 TLL1O43897 1013 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 FECHP22830 423 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 GFRA3O60609 400 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 ADH1BP00325 375 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 RDH13Q8NBN7 331 aa7.19□□□□□ -1.26
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RNU6-890P-201ENST00000384121 SULF1Q8IWU6 871 aa7.18□□□□□ -1.26
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RNU6-890P-201ENST00000384121 S1PR4O95977 384 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 NLRP7Q8WX94 980 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC19A1P41440 591 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 MAP2K5Q13163 448 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-890P-201ENST00000384121 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-890P-201ENST00000384121 PHOX2BQ99453 314 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-890P-201ENST00000384121 FUT2Q10981 343 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-890P-201ENST00000384121 SPSB2Q99619 263 aa7.13□□□□□ -1.27
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RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-890P-201ENST00000384121 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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RNU6-890P-201ENST00000384121 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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RNU6-890P-201ENST00000384121 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-890P-201ENST00000384121 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.09□□□□□ -1.27
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RNU6-890P-201ENST00000384121 THAP11Q96EK4 314 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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RNU6-890P-201ENST00000384121 PRR20CP86479 221 aa7.07□□□□□ -1.28
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RNU6-890P-201ENST00000384121 MSS51Q4VC12 460 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 BRICD5Q6PL45 260 aa7.05□□□□□ -1.28
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RNU6-890P-201ENST00000384121 KDM4AO75164 1064 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 CLCN1P35523 988 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 RPIAP49247 311 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 USP46P62068 366 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 DGAT1O75907 488 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 PKDCCQ504Y2 493 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-890P-201ENST00000384121 TNFRSF10AO00220 468 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-890P-201ENST00000384121 GDF9O60383 454 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-890P-201ENST00000384121 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM187AA6NFU0 413 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-890P-201ENST00000384121 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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