RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 CDCA8Q53HL2 280 aa9.51□□□□□ -0.89
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KCNQ1-204ENST00000380776 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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KCNQ1-204ENST00000380776 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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KCNQ1-204ENST00000380776 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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KCNQ1-204ENST00000380776 ABCC11Q96J66 1382 aa9.34□□□□□ -0.91
KCNQ1-204ENST00000380776 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.34□□□□□ -0.91
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KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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KCNQ1-204ENST00000380776 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.32□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.32□□□□□ -0.92
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KCNQ1-204ENST00000380776 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.31□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.31□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 DIP2AQ14689 1571 aa9.3□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 PTPRMP28827 1452 aa9.3□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.3□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 NLRP13Q86W25 1043 aa9.3□□□□□ -0.92
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KCNQ1-204ENST00000380776 TECPR2O15040 1411 aa9.3□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 TMC1Q8TDI8 760 aa9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 PRAM1Q96QH2 718 aa9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 TBX22Q9Y458 520 aa9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 PIK3R4Q99570 1358 aa9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.28□□□□□ -0.92
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