RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYND15Q9H091 742 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 ASXL2Q76L83 1435 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 ITGAEP38570 1179 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 AKNAQ7Z591 1439 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP5Q13017 1502 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM66O15016 1216 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 PLCH2O75038 1416 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 KCNH8Q96L42 1107 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF5Q12774 1597 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 PDE4DQ08499 809 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 DAPK1P53355 1430 aa9.84□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK2BQ13554 666 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 HFM1A2PYH4 1435 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ROCK1Q13464 1354 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 TONSLQ96HA7 1378 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.83□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 FAM117AQ9C073 453 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 DPYSL4O14531 572 aa9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC5O15440 1437 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP74Q9C0B2 1584 aa9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRKQ15262 1439 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 TRPC6Q9Y210 931 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRL2O95490 1459 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 TSPY4P0CV99 314 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 TSPY10P0CW01 314 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM52Q96A61 297 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 GLI2P10070 1586 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 NAIPQ13075 1403 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 MBD5Q9P267 1494 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 PHF12Q96QT6 1004 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC1P33527 1531 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 FANCAO15360 1455 aa9.77□□□□□ -0.84
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA2Q08379 1002 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 CD109Q6YHK3 1445 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 NCOA1Q15788 1441 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 50.4
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 NEO1Q92859 1461 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 POTEHQ6S545 545 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 PLXNC1O60486 1568 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 DIP2BQ9P265 1576 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRL1O94910 1474 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 DSG2Q14126 1118 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.71□□□□□ -0.85
CTPS1-201ENST00000372616 GPR37O15354 613 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 KIF15Q9NS87 1388 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 APBB1O00213 710 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM2FA1L443 756 aa9.68□□□□□ -0.86
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