RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS3-201ENST00000355530 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 ATP7AQ04656 1500 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 MS4A1P11836 297 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R1AP30153 589 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 PIK3C2GO75747 1445 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 KANK1Q14678 1352 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS3-201ENST00000355530 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 AFAP1Q8N556 730 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 MYOM2P54296 1465 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 PLIN1O60240 522 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 PDE4AP27815 886 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 FANCAO15360 1455 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 CRBNQ96SW2 442 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 ABCA6Q8N139 1617 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 BACH2Q9BYV9 841 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 IFT172Q9UG01 1749 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS3-201ENST00000355530 KIF1BO60333 1816 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF521Q96K83 1311 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC24A1O60721 1099 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 NBR1Q14596 966 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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SPNS3-201ENST00000355530 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRL1O94910 1474 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA2Q08379 1002 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS3-201ENST00000355530 ERVK-7P63135 1459 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 MROH2AA6NES4 1674 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 KIF3BO15066 747 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
SPNS3-201ENST00000355530 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 SLFN5Q08AF3 891 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRB3O60242 1522 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SPNS3-201ENST00000355530 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 PPLO60437 1756 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 ASXL2Q76L83 1435 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 E9PSI1 815 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 APAF1O14727 1248 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 SKAP1Q86WV1 359 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 NOS1P29475 1434 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS3-201ENST00000355530 SHPRHQ149N8 1683 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 USP35Q9P2H5 1018 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 USP32Q8NFA0 1604 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRB1O14514 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 FAM161AQ3B820 660 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS3-201ENST00000355530 NPATQ14207 1427 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 NEFMP07197 916 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 C8orf34Q49A92 452 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 BCAR3O75815 825 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 PDE3AQ14432 1141 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS3-201ENST00000355530 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.65■■□□□ 1.38
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