RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRR-202ENST00000342084 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 TRPM2O94759 1503 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRR-202ENST00000342084 CEP152O94986 1710 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-202ENST00000342084 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.61□□□□□ -0.87
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PTPRR-202ENST00000342084 SYNMO15061 1565 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRR-202ENST00000342084 ABCA6Q8N139 1617 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF521Q96K83 1311 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-202ENST00000342084 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRR-202ENST00000342084 MS4A1P11836 297 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRR-202ENST00000342084 NOS1P29475 1434 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRR-202ENST00000342084 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRR-202ENST00000342084 STAC3Q96MF2 364 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 ADGRB3O60242 1522 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 C8orf34Q49A92 452 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRR-202ENST00000342084 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRR-202ENST00000342084 E9PSI1 815 aa9.46□□□□□ -0.89
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