RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX2-201ENST00000306732 ZNF521Q96K83 1311 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX2-201ENST00000306732 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 SLC4A3P48751 1232 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 GOLGA2Q08379 1002 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 IQGAP1P46940 1657 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 MADDQ8WXG6 1647 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 C8orf34Q49A92 452 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 PLCH2O75038 1416 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX2-201ENST00000306732 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 SYNMO15061 1565 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 FAM161AQ3B820 660 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 NFKBIBQ15653 356 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 SLFN5Q08AF3 891 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 PIK3C2GO75747 1445 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 MYOM1P52179 1685 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PITX2-201ENST00000306732 ABCC1P33527 1531 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 RGS3P49796 1198 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 GSE1Q14687 1217 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 CDCA8Q53HL2 280 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 APAF1O14727 1248 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 TRPM2O94759 1503 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX2-201ENST00000306732 BCAR3O75815 825 aa25.58■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 CEP152O94986 1710 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 CLTCL1P53675 1640 aa25.55■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX2-201ENST00000306732 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 PTPRTO14522 1441 aa25.51■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 E9PSI1 815 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 IGHDP01880 384 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 STAC3Q96MF2 364 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PITX2-201ENST00000306732 ERVK-7P63135 1459 aa25.45■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.45■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 AFAP1Q8N556 730 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 USP19O94966 1318 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 DEPDC5O75140 1603 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 TET3O43151 1660 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 PDE3AQ14432 1141 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 PANK1Q8TE04 598 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 COG6Q9Y2V7 657 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX2-201ENST00000306732 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.39■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 SEC24BO95487 1268 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 ABCA6Q8N139 1617 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 WWC1Q8IX03 1113 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 NGEFQ8N5V2 710 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 FANCAO15360 1455 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 ATP7AQ04656 1500 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX2-201ENST00000306732 MYOM2P54296 1465 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 NLRP1Q9C000 1473 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 KANK1Q14678 1352 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 NEUROD2Q15784 382 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 SHPRHQ149N8 1683 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PITX2-201ENST00000306732 KIF3BO15066 747 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms