RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 EVC2Q86UK5 1308 aa20.53■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 RUNDC1Q96C34 613 aa20.51■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.51■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.51■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 NFKBIBQ15653 356 aa20.5■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.49■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.49■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 NRDCO43847 1150 aa20.48■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 ERBINQ96RT1 1412 aa20.47■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.46■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.46■□□□□ 0.87
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.45■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.45■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 BCAR3O75815 825 aa20.45■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.45■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 ARHGEF11O15085 1522 aa20.45■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.45■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 MTHFSP49914 203 aa20.43■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.42■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.41■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 PTMSP20962 102 aa20.41■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 DRC7Q8IY82 874 aa20.4■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 RIPK4P57078 832 aa20.4■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 SKAP1Q86WV1 359 aa20.4■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.4■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
MEGF6-201ENST00000294599 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.38■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.38■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.38■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 PDE3AQ14432 1141 aa20.37■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.36■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 STK31Q9BXU1 1019 aa20.36■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.36■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 CABP2Q9NPB3 220 aa20.36■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 GRIN2AQ12879 1464 aa20.36■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.35■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.35■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.34■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 NUTM2FA1L443 756 aa20.34■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 HMMRO75330 724 aa20.34■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 AAMPQ13685 434 aa20.34■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
MEGF6-201ENST00000294599 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.33■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.33■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 LNPKQ9C0E8 428 aa20.32■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 SLFN5Q08AF3 891 aa20.32■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 ARID3AQ99856 593 aa20.31■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.31■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.31■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.3■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 KIF16BQ96L93 1317 aa20.29■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.28■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 COG3Q96JB2 828 aa20.28■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.28■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 NPHP1O15259 732 aa20.27■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 IL27Q8NEV9 243 aa20.27■□□□□ 0.84
MEGF6-201ENST00000294599 HMOX1P09601 288 aa20.26■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.26■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 ST18O60284 1047 aa20.24■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.24■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.24■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 WWC1Q8IX03 1113 aa20.23■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 KIF14Q15058 1648 aa20.23■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.23■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.22■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 AMPHP49418 695 aa20.21■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 WDR63Q8IWG1 891 aa20.21■□□□□ 0.83
MEGF6-201ENST00000294599 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 GNAI1P63096 354 aa20.19■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.17■□□□□ 0.82
MEGF6-201ENST00000294599 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms