RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 KANK1Q14678 1352 aa37.24■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.24■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.22■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 KIF3BO15066 747 aa37.21■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 SYNMO15061 1565 aa37.2■■■■□ 3.55
UBP1-201ENST00000283628 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.18■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 EXOC6Q8TAG9 804 aa37.18■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 CLTCL1P53675 1640 aa37.18■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 CDCA8Q53HL2 280 aa37.17■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.17■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.16■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa37.15■■■■□ 3.54
UBP1-201ENST00000283628 GLI2P10070 1586 aa37.13■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.13■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 CDCA7LQ96GN5 454 aa37.12■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.1■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.09■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.09■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.07■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 ABCA6Q8N139 1617 aa37.06■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.04■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 MYOM1P52179 1685 aa37.03■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37.03■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R1AP30153 589 aa37.02■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
UBP1-201ENST00000283628 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 RICTORQ6R327 1708 aa37■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTS8Q9UP79 889 aa37■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 PIK3C2GO75747 1445 aa36.99■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 MS4A1P11836 297 aa36.98■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 SLC24A1O60721 1099 aa36.97■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 MYOM2P54296 1465 aa36.96■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.96■■■■□ 3.51
UBP1-201ENST00000283628 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.94■■■■□ 3.5
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEF3O95398 923 aa36.94■■■■□ 3.5
UBP1-201ENST00000283628 DIP2BQ9P265 1576 aa36.93■■■■□ 3.5
UBP1-201ENST00000283628 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
UBP1-201ENST00000283628 KIF1BO60333 1816 aa36.9■■■■□ 3.5
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 IFT172Q9UG01 1749 aa36.87■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 ZNF521Q96K83 1311 aa36.87■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 PLIN1O60240 522 aa36.86■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.86■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 CRBNQ96SW2 442 aa36.85■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.84■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 PDE4AP27815 886 aa36.83■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 BCL11AQ9H165 835 aa36.82■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 ABCC3O15438 1527 aa36.82■■■■□ 3.49
UBP1-201ENST00000283628 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.81■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 BACH2Q9BYV9 841 aa36.81■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.79■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA2Q08379 1002 aa36.79■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.79■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 ERVK-7P63135 1459 aa36.79■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 NPATQ14207 1427 aa36.79■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 GGT6Q6P531 493 aa36.78■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.77■■■■□ 3.48
UBP1-201ENST00000283628 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.75■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 MROH2AA6NES4 1674 aa36.74■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.74■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.74■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 ADGRB3O60242 1522 aa36.72■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.72■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.7■■■■□ 3.47
UBP1-201ENST00000283628 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.69■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 SLFN5Q08AF3 891 aa36.69■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 C20orf194Q5TEA3 1177 aa36.67■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 NGEFQ8N5V2 710 aa36.67■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 KDM2BQ8NHM5 1336 aa36.66■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 TSPOAP1O95153 1857 aa36.65■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 NBR1Q14596 966 aa36.65■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.46
UBP1-201ENST00000283628 NOS1P29475 1434 aa36.63■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 DEKP35659 375 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.62■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.62■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.58■■■■□ 3.45
UBP1-201ENST00000283628 PIK3C2BO00750 1634 aa36.57■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 PPLO60437 1756 aa36.55■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.55■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 APAF1O14727 1248 aa36.54■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 E9PSI1 815 aa36.54■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
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