RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
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PTPRR-201ENST00000283228 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRR-201ENST00000283228 PPP2R1AP30153 589 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRR-201ENST00000283228 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
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PTPRR-201ENST00000283228 IFT140Q96RY7 1462 aa14.25□□□□□ -0.13
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PTPRR-201ENST00000283228 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRR-201ENST00000283228 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRR-201ENST00000283228 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
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PTPRR-201ENST00000283228 PLCB2Q00722 1185 aa14.18□□□□□ -0.14
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PTPRR-201ENST00000283228 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.15□□□□□ -0.14
PTPRR-201ENST00000283228 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRR-201ENST00000283228 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.15□□□□□ -0.14
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PTPRR-201ENST00000283228 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRR-201ENST00000283228 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF521Q96K83 1311 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 WWC1Q8IX03 1113 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 KIF14Q15058 1648 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA0556O60303 1618 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF11O15085 1522 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 ERBINQ96RT1 1412 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 TESK2Q96S53 571 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.13□□□□□ -0.15
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