RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264734.2

CLDN16-201, Transcript of claudin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN16, Length 3,273 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-201ENST00000264734 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.84□□□□□ -0.51
CLDN16-201ENST00000264734 KDM4AO75164 1064 aa11.84□□□□□ -0.51
CLDN16-201ENST00000264734 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CLDN16-201ENST00000264734 PIK3C2BO00750 1634 aa11.83□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.83□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.82□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 NCOA2Q15596 1464 aa11.81□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 ANP32CO43423 234 aa11.8□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC27Q2M243 656 aa11.8□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.8□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 IFT172Q9UG01 1749 aa11.79□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.79□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 NEFMP07197 916 aa11.79□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 TEX2Q8IWB9 1127 aa11.78□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.78□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 CCER2I3L3R5 266 aa11.78□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.78□□□□□ -0.52
CLDN16-201ENST00000264734 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.77□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.76□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 ROCK1Q13464 1354 aa11.76□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.76□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.76□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.75□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.73□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 WWC1Q8IX03 1113 aa11.72□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 TET3O43151 1660 aa11.72□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 ATP10AO60312 1499 aa11.71□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 ATP7AQ04656 1500 aa11.71□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 E9PSI1 815 aa11.71□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.71□□□□□ -0.53
CLDN16-201ENST00000264734 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 KDM6BO15054 1643 aa11.7□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.69□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 ERBINQ96RT1 1412 aa11.69□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.68□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 MADDQ8WXG6 1647 aa11.68□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.67□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 CEP152O94986 1710 aa11.67□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.67□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CLDN16-201ENST00000264734 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.65□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 GSE1Q14687 1217 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 FANCAO15360 1455 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 ANAPC15P60006 121 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 PTMSP20962 102 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 C3P01024 1663 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 DAPK1P53355 1430 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 ABCC5O15440 1437 aa11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 E9PCH4 1651 aa11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 LAMC1P11047 1609 aa11.6□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 RGL2O15211 777 aa11.59□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.59□□□□□ -0.55
CLDN16-201ENST00000264734 CD109Q6YHK3 1445 aa11.58□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 HFM1A2PYH4 1435 aa11.58□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 TSPOAP1O95153 1857 aa11.57□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.56□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.55□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.55□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC125Q86Z20 511 aa11.55□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 GPATCH11Q8N954 259 aa11.55□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.54□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.54□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CLDN16-201ENST00000264734 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms