RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.41■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.41■■■□□ 2.3
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYOM2P54296 1465 aa29.39■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.39■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.38■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF1BO60333 1816 aa29.37■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.35■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.35■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYOM1P52179 1685 aa29.35■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.35■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP2R1AP30153 589 aa29.35■■■□□ 2.29
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.33■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.33■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC24A1O60721 1099 aa29.33■■■□□ 2.29
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IFT172Q9UG01 1749 aa29.33■■■□□ 2.29
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCA6Q8N139 1617 aa29.32■■■□□ 2.28
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.3■■■□□ 2.28
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.29■■■□□ 2.28
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.29■■■□□ 2.28
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.28■■■□□ 2.28
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.27■■■□□ 2.28
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PIK3C2GO75747 1445 aa29.27■■■□□ 2.28
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MROH2AA6NES4 1674 aa29.26■■■□□ 2.27
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.25■■■□□ 2.27
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERVK-7P63135 1459 aa29.23■■■□□ 2.27
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADGRB3O60242 1522 aa29.22■■■□□ 2.27
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.21■■■□□ 2.27
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CD109Q6YHK3 1445 aa29.2■■■□□ 2.27
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.2■■■□□ 2.27
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.18■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.18■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.17■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.17■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 OSCARQ8IYS5 282 aa29.17■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NPATQ14207 1427 aa29.15■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.15■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NOS1P29475 1434 aa29.15■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.15■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF521Q96K83 1311 aa29.14■■■□□ 2.26
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPLO60437 1756 aa29.11■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLIN1O60240 522 aa29.1■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.1■■■□□ 2.25
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.09■■■□□ 2.25
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEO1Q92859 1461 aa29.02■■■□□ 2.24
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-201ENST00000216121 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.98■■■□□ 2.23
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 MS4A1P11836 297 aa28.98■■■□□ 2.23
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.97■■■□□ 2.23
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.95■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.95■■■□□ 2.22
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NIPSNAP1-201ENST00000216121 RAPGEF3O95398 923 aa28.92■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDE4AP27815 886 aa28.9■■■□□ 2.22
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.89■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.89■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BACH2Q9BYV9 841 aa28.88■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 USP32Q8NFA0 1604 aa28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 E9PSI1 815 aa28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GLI2P10070 1586 aa28.87■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MORC1Q86VD1 984 aa28.85■■■□□ 2.21
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RICTORQ6R327 1708 aa28.85■■■□□ 2.21
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