RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 NUB1Q9Y5A7 615 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PASKQ96RG2 1323 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 THAP12O43422 761 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PROSCO94903 275 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 NOMO3P69849 1222 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 AADACL2Q6P093 401 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 MPZL3Q6UWV2 235 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 LRRC31Q6UY01 552 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB33Q86T24 672 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 C18orf8Q96DM3 657 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TRIM31Q9BZY9 425 aa19.75■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ACKR2O00590 384 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FSCN2O14926 492 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FAM189A1O60320 539 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TXNP10599 105 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZNF132P52740 706 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SNAPC2Q13487 334 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TRPC3Q13507 836 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 Q3C1V9 767 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 WDR78Q5VTH9 848 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 C9orf131Q5VYM1 1079 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CCDC105Q8IYK2 499 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 LRRC19Q9H756 370 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB42B2RXF5 422 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 H0YGN5 161 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PSTPIP1O43586 416 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PPFIA4O75335 1185 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 LSM8O95777 96 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 IRAK1P51617 712 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CCNA1P78396 465 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 AGBL2Q5U5Z8 902 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 RHPN2Q8IUC4 686 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 LRRC71Q8N4P6 559 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 UBR7Q8N806 425 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 NIF3L1Q9GZT8 377 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 HOMER3Q9NSC5 361 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 NFS1Q9Y697 457 aa19.73■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 IL18RAPO95256 599 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CALCAP01258 141 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TNNC2P02585 160 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 RARAP10276 462 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 NR1D1P20393 614 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PROZP22891 400 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 EPHX2P34913 555 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 GNGT1P63211 74 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZNF484Q5JVG2 852 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ATF7IP2Q5U623 682 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 MOB2Q70IA6 237 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CROCCP2Q86T23 111 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TRIM50Q86XT4 487 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SLCO2A1Q92959 643 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FZD8Q9H461 694 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PARVAQ9NVD7 372 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ERAP1Q9NZ08 941 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SNX24Q9Y343 169 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ECEL1O95672 775 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CALB1P05937 261 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TMEM191BP0C7N4 346 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 CETN2P41208 172 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TNFSF9P41273 254 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 LAMC2Q13753 1193 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SEZ6Q53EL9 994 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 KCTD16Q68DU8 428 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 RHOT1Q8IXI2 618 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 C11orf70Q9BRQ4 267 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 NFKBIZQ9BYH8 718 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa19.72■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 UNCXA6NJT0 531 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ABLIM1O14639 778 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FLT3P36888 993 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 PLTPP55058 493 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 POU5F1BQ06416 359 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZNF844Q08AG5 666 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 ZNF568Q3ZCX4 644 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 SGO2Q562F6 1265 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 TTC27Q6P3X3 843 aa19.71■□□□□ 0.75
CLN8-211ENST00000636934 FAM212AQ96EL1 285 aa19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms