RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 DPYDQ12882 1025 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 DCLK2Q8N568 766 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL16O15467 120 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 RECQL4O94761 1208 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 POU2F2P09086 479 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PP2D1A8MPX8 630 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 AMPD3Q01432 767 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MLKLQ8NB16 471 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF214Q8ND24 703 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MED24O75448 989 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB33AQ14088 237 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MORC3Q14149 939 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP57Q86XR8 500 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ERMNQ8TAM6 284 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CBX8Q9HC52 389 aa26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA7A6NL88 538 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 THP07101 528 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFR3P22607 806 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCB1Q15051 598 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN9Q5TKA1 542 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A14Q8TBB6 771 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RUBCNQ92622 972 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 N4BP3O15049 544 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCG1P19174 1290 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MUTP22033 750 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SHDQ96IW2 340 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA5Q96PV4 448 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 KXD1Q9BQD3 176 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RMND1Q9NWS8 449 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MTRRQ9UBK8 725 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DACH1Q9UI36 760 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKCQQ04759 706 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 MTSS1LQ765P7 747 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL6Q9BZF3 934 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIP11Q15643 1979 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ACKR2O00590 384 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR29P0C7W0 189 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1D2P34982 312 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 AFMP43652 599 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNB1Q14721 858 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf58Q8NDZ4 430 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 LTB4R2Q9NPC1 389 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 IKBKBO14920 756 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 XYLBO75191 536 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKCBP05771 671 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CD72P21854 359 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 RPA1P27694 616 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A9Q2M3M2 681 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 NELL1Q92832 810 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 POLIQ9UNA4 740 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 SMTNL1A8MU46 457 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 FZD5Q13467 585 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PDXDC1Q6P996 788 aa26.27■■□□□ 1.8
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