RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 TEX9Q8N6V9 391 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 DNERQ8NFT8 737 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 KRT35Q92764 455 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 RARAP10276 462 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ABCD1P33897 745 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 CNTN2Q02246 1040 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 PRKG1Q13976 671 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 EMC2Q15006 297 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 CHST13Q8NET6 341 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF516Q92618 1163 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 LCTP09848 1927 aa21.77■■□□□ 1.08
HDGFL2-208ENST00000616600 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 GRIN3BO60391 1043 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 CYP1A2P05177 515 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 CHN1P15882 459 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 COMTP21964 271 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PEX5P50542 639 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PDE6CP51160 858 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 CLUL1Q15846 466 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PPP2R5EQ16537 467 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 KCNN1Q92952 543 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 EXTL3O43909 919 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 MMP13P45452 471 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 MARCKSL1P49006 195 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 CLDN10P78369 228 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 GCNT1Q02742 428 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 MESDQ14696 234 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 AADACL2Q6P093 401 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ERICH1Q86X53 443 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 MORC4Q8TE76 937 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF302Q9NR11 478 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.76■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 LIG4P49917 911 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 SNX1Q13596 522 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 CD101Q93033 1021 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM143Q96AN5 459 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM84AQ96KN4 292 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 OATP04181 439 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 COPB2P35606 906 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 GALNTL6Q49A17 601 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 LBX2Q6XYB7 198 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 NUP85Q9BW27 656 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PORCNQ9H237 461 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.75■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PEX10O60683 326 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 PSMD6Q15008 389 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 HOOK3Q86VS8 718 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.74■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ABLIM1O14639 778 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 UBOX5O94941 541 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 GLRA2P23416 452 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 WNT7BP56706 349 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 TREML2Q5T2D2 321 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.73■■□□□ 1.07
HDGFL2-208ENST00000616600 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms