RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-215ENST00000602164 CREMQ03060 361 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PSMD5Q16401 504 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 NT5DC4Q86YG4 428 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 CCDC34Q96HJ3 373 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 NUB1Q9Y5A7 615 aa29.07■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 C9orf57Q5W0N0 161 aa29.06■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SPATA20Q8TB22 786 aa29.06■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 CLSTN3Q9BQT9 956 aa29.06■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PDE11AQ9HCR9 933 aa29.06■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PIRO00625 290 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SYN3O14994 580 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 MCM4P33991 863 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PDXDC1Q6P996 788 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 TMEM174Q8WUU8 243 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 FAM84AQ96KN4 292 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 KIAA1586Q9HCI6 787 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 DZANK1Q9NVP4 752 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 MTRRQ9UBK8 725 aa29.05■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 ZNF233A6NK53 670 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 M0QZQ0 153 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 ADAM12O43184 909 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 C1RP00736 705 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 CYP2J2P51589 502 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 LILRA6Q6PI73 481 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 XXYLT1Q8NBI6 393 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 GOLGA5Q8TBA6 731 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SUSD6Q92537 303 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 DPP3Q9NY33 737 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 TTC28Q96AY4 2481 aa29.04■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PTPRJQ12913 1337 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SPTLC1O15269 473 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 CXorf38Q8TB03 319 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 DMAC2Q9NW81 257 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PCDHB8Q9UN66 801 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.03■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PDXKO00764 312 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 TBC1D4O60343 1298 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 GLUD1P00367 558 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 ANKS3Q6ZW76 656 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SLC9A9Q8IVB4 645 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 GLYCTKQ8IVS8 523 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 FEZF2Q8TBJ5 459 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 GSDMAQ96QA5 445 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 SCN1AP35498 2009 aa29.02■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 TSC2P49815 1807 aa29.01■■■□□ 2.24
USF2-215ENST00000602164 TGM5O43548 720 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 KINO60870 393 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 LILRA4P59901 499 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 UBE2HP62256 183 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 PALB2Q86YC2 1186 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 APOL5Q9BWW9 433 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 FAM50BQ9Y247 325 aa29.01■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 CYP24A1Q07973 514 aa29■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 CDH22Q9UJ99 828 aa29■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 KIF20AO95235 890 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 PAX3P23760 479 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 RAB33AQ14088 237 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 PSMD6Q15008 389 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 SURF1Q15526 300 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 RDH13Q8NBN7 331 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 BORCS6Q96GS4 357 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 ADAM7Q9H2U9 754 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 SFXN1Q9H9B4 322 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 INTS13Q9NVM9 706 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 RMND1Q9NWS8 449 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.99■■■□□ 2.23
USF2-215ENST00000602164 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms